Transcriptomique & biologie moléculaire

Date de mise à jour : 8 janvier 2016

L'unité s'est équipée de matériels performants afin d'entreprendre des analyses fines de biologie moléculaire, du dosage des acides nucléiques à l'étude d'expression de gènes pouvant aller jusqu'au haut débit.
  • Spectrophotomètre NanoDrop (Thermo scientific) pour le dosage des acides nucléiques
    NanoDrop 2000 Spectrophotometer. © Thermo Scientific
     
  • 2100 BioAnalyzer (Agilent) pour le contrôle qualité des acides nucléiques.

  • Plateforme de micro-arrays pour l’analyse à haut débit d’acides nucléiques purifiés (ADN et ARN) issus de cellules eucaryotes ou procaryotes : une station de marquage et d’hybridation des échantillons (1 ou 2 couleurs) et un scanner Agilent pour la lecture des micro-arrays. L’extraction des données se fait avec le logiciel Feature Extraction (Agilent).
  • Plateau de séquençage haut débit (Guadeloupe) : séquenceur de paillasse Ion Torrent™
  • Appareils QPCR Mx3005P (Agilent) et PCR.
  • Logiciel GeneSpring GX (Agilent) pour la visualisation, la validation et l'analyse statistique de données de transcriptomique, génomique, protéomique et métabolomique.

Date de mise à jour : 8 janvier 2016

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